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Biologie numérique pour explorer et prédire le vivant

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Illustration thèse confinancée
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03 février 2026

Rédaction : Marjorie Domergue

Estimation de la dynamique du développement architectural du blé à partir de données de phénotypage à haut débit en champ à l'aide d'une approche hybride combinant IA et modèle plante en 3D

Thèse d'Aurélien Besnier (2025 - 2028 , UMR EMMAH). Cette thèse vise à estimer les traits de développement architectural du blé à l’échelle des organes grâce au Phenomobile V2, un rover de phénotypage à haut débit. Elle s’appuie sur une approche innovante combinant intelligence artificielle et modélisation 3D dynamique pour analyser la structure du blé en conditions de terrain.
Illustration thèse confinancée

Thèse de Julien Kossi Kowou (2025 - 2028, UMR GABI). Ce projet de thèse se propose de développer des méthodes d’analyse statistique pour explorer la diversité génétique inter-espèces.

bandeau IA en sciences du vivant : focus sur des domaines d'applications © REZOOmarketing
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Notre série de webinaires « L’IA en Sciences du vivant : focus sur des domaines d’applications » se poursuit en janvier avec une 3ème séance consacrée à l'IA pour la représentation par graphes de connaissances.

Photo d'un puceron © wirestock, Freepik

La pression exercée par les insectes ravageurs comme les pucerons et l’incidence des maladies virales qu’ils transmettent est en constante augmentation. Le changement climatique, la réduction des insecticides et l’apparition de résistances aux insecticides encore autorisés favorisent fortement leur cycle de vie et leur dynamique populationnelle. Face à la nécessité de réduire l’utilisation des insecticides, de nouvelles approches agro-écologiques ont émergé ces dernières décennies, utilisant la diversité génétique des plantes cultivées pour modifier à notre avantage le comportement ou les performances des pucerons. Ces approches nécessitent une caractérisation précise de la diversité génétique végétale et il n'existe actuellement aucun système de phénotypage ouvert, performant, standardisé et abordable pour des applications futures. Afin de lever ce verrou, le consortium Gratitude propose de développer un système digital de phénotypage « plante-puceron » capable de caractériser le développement et le comportement de ces insectes ravageurs.

Ouvrir le champ des possibles

Développer des approches intégratives afin d'explorer et prédire le comportement de systèmes vivants

L'accroissement exponentiel du volume de données et les récentes avancées en biologie ouvrent des possibilités inespérées pour étudier les systèmes biologiques dans leur globalité et leur complexité, tout autant qu'ils requièrent des approches et des outils adaptés.

Le Métaprogramme Digit-Bio se focalise sur la modélisation du vivant depuis l'échelle de la molécule jusqu'à celle de l'organisme et de la population.
Notre ambition : décrypter les grandes fonctions et mécanismes du vivant, pour en étudier et en prédire le comportement dans des environnements fluctuants, et in fine aider à la gestion et au pilotage de ces systèmes.