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Dans le noyau d'une cellule animale ou végétale, la conformation tridimensionnelle du génome a un impact majeur sur son fonctionnement. Mieux comprendre les liens entre la structure 3D du génome et son fonctionnement représente un défi méthodologique majeur qui nécessite un dialogue entre différentes disciplines.

La compréhension du déterminisme génétique d’un caractère, c’est-à-dire de l'ensemble des gènes impliqués dans l'élaboration et l'expression de ce caractère, est un enjeu majeur pour mieux appréhender les processus biologiques et appuyer les programmes d’amélioration génétique.

En biologie, comme dans d’autres domaines scientifiques, l’intégration de données multi-sources est plus que jamais d’actualité. En effet, les données collectées sont de plus en plus complexes et leur volume ne cesse de croître, du fait du développement des plateformes analytiques, des techniques d'imagerie ou de l'essor des données omiques.

En réponse aux multiples enjeux du changement climatique et des multi-performances de l’agriculture, les sciences de l’élevage et des plantes se voient confrontées au défi de sélectionner des races ou des variétés sur la base de phénotypes de plus en plus complexes.

Le consortium IFM2A2 propose de rapprocher durablement les différentes communautés scientifiques qui travaillent aujourd’hui séparément à simuler le fonctionnement des méristèmes apicaux à différentes échelles, opérant dans différents départements d’INRAE (BAP, MAthNum et AgroEoSystem) en forte interaction avec l’INRIA.

Un enjeu majeur de la fécondation in vitro (FIV) est la sélection du « meilleur » embryon, c’est-à-dire le plus apte à s’implanter dans la muqueuse utérine. Le consortium BovMovie2Pred vise à proposer des solutions pour aider à la sélection précoce d’embryons bovins afin d’augmenter le pourcentage de naissances viables issues d’embryons fécondés in vitro.