L'IA en sciences du vivant

Ouvert aux biologistes et aux méthodologistes, ce cycle de séminaires et webinaires propose un apprentissage commun, pour :

• partager un vocabulaire et des méthodologies d’IA ;
• sensibiliser aux applications d’IA propres aux sciences du vivant ;
• identifier des questions biologiques pour lesquelles des développements en IA méritent d’être poursuivis ;

Le format des animations propose un cours pour explorer une méthodologie d'IA, suivie d'une étude de cas présentée par un binôme biologiste/ méthodologiste.

En savoir plus ? Contacter la cellule d'animation DIGIT-BIO IA  :  Julien Chiquet, Marie-Laure Martin et Christèle Robert Granié

L'ensemble des séances 2022-2023 sont disponibles en replay :

• Séance 0 : Introduction au Machine Learning (Liva Ravaivola)
• Séance 1 : Machine Learning pour la classification supervisée
  Cours : Comment faire des prédictions à partir de vos données biologiques grâce au Machine Learning ? De la régression logistique aux réseaux de neurones - Blaise Hanczar
  Étude de cas : Explorer le paysage cellulaire avec le Deep Learning - Emmanuel Moebel, Fadwa Fatmaoui
• Séance 2 : Identification de structure par classification non-supervisée
  Cours : Comment trouver des structures dans vos données biologiques avec la classification non supervisée ? Méthodes de distance, modèles de mélange ou réseaux de neurones - Cathy Maugis Rabusseau
  Étude de cas : Comprendre les interactions et l'organisation des réseaux écologiques grâce à l’analyse de réseaux - Apprentissage non supervisé de structures de graphes - Sophie Donnet, François Massol 
• Séance 3 : Identification de structure par réduction de dimension
  Cours : De l’analyse en composantes principales aux auto-encodeurs variationnels - Stéphanie Allassonnière
  Étude de cas : Quelle est la dimension pertinente de l’espace d’expression des gènes? -  Olivier Gandrillon , Franck Picard
• Séance 4 : Traitement automatique des langues
  Cours : Comment extraire automatiquement des informations de documents textuels ?  - Arnaud Ferre (Inrae - MaiAge)
  Étude de cas : Mise en pratique de l'Extraction d'Informations dans le domaine de la biodiversité microbienne - Robert Bossy (Inrae - MaiAge)