Transfer du modèle d’allocation de ressources, d’Arabidopsis au jeune fruit de tomate, pour prédire la croissance avec un changement d’environnement et proposer des cibles d’amélioration agronomique

En effet, les modèles du métabolisme développés pour élucider les mécanismes physiologiques au cours du développement du fruit permettent d’estimer des flux métaboliques et le turnover des protéines, données difficiles à appréhender expérimentalement à large échelle. Toutefois, les modèles sous-contraintes ne permettent pas de simuler des flux et de prédire un phénotype. 

Compte tenu de l’importance du rôle des protéines dans le développement des fruits et des capacités des modèles à base de ressource, l’objectif de ce projet est de construire un modèle de type Ressource Balance Analysis (RBA) du fruit, capable de simuler des flux métaboliques et donc prédire des phénotypes d’intérêt agronomique. Les données déjà acquises par MéTA et disponibles, à la fois omiques (transcriptomique, protéomique, métabolomique) et celles issues d’expériences de marquage (C13 et N15) permettront de calibrer puis de valider le modèle. Ainsi, le doctorant pourra étudier les réponses du modèle aux variations de conditions nutritionnelles de croissance ou à un scénario de température donné, afin de proposer des cibles d’amélioration.

Contact

• Chloé Ladreyt