Thèse de Chloé Weckel (2024 -2026)

Modélisation spatio-temporelle des voies de signalisation : impact de la compartimentation endosomale et application aux recepteurs aux gonadotrophines

Thèse de Chloé Weckel (PRC, 2024-2026). Dans la continuité du projet exploratoire IMAGO financé par DIGIT-BIO, cette thèse vise à développer de nouveaux formalismes pour décrire les dynamiques spatio-temporelles de la signalisation cellulaire.

  • Date de démarrage : 01/10/2024
  • Unité d'accueil : PRC
  • Centre INRAE : Val de Loire
  • Université :  Université de Tours 
  • École doctorale :  Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (ED SSBCV 549)
  • Discipline / Spécialité : Mathématiques
  • Directeur de thèse : Romain Yvinec, Stefan Haar (Inria) 
  • Encadrant(es) : Frédéric Jean-Alphonse 
  • Financement : INRIA (appel à thèse INRAE-INRIA 2024)
  • Axe du métaprogramme : Axe 1 (décryptage des fonctions du vivant et réponses aux changements de champs de contraintes)

Résumé

Ce projet de thèse vise à développer de nouveaux modèles dynamiques pour décrire la compartimentation des voies de signalisations. A l’aide de formalismes hybrides, développés dans des communautés probabilistes et informatiques, ainsi que des données de signalisation cinétique et d’imagerie par fluorescence en cellule unique, nous étudierons le rôle du trafic des récepteurs dans les vésicules endosomales sur la réponse cellulaire a une stimulation extra-cellulaire.

Nous chercherons à comprendre les états stationnaires possibles et la variabilité et / ou robustesse induite par la compartimentation. Nous développerons ensuite des algorithmes de simulations et d’inférence de paramètres pour la caractérisation de la pharmacologie des récepteurs. Cette méthodologie sera appliquée aux récepteurs aux gonadotrophines, dans un contexte de développement de stratégies non-hormonale en maîtrise de la reproduction.

Ce projet est réalisé au sein de l’équipe interdisciplinaire MUSCA, composée de biologistes, mathématiciens et informaticiens et tirera partie de croisement d’approches entre des modèles discrets et des modèles continus ou hybrides. 

Dans la continuité du projet exploratoire IMAGO (2022-2024), cette thèse vise à poursuivre le développement de nouveaux formalismes pour décrire les dynamiques spatio-temporelles de la signalisation cellulaire.

Contact :

Photo de Chloé Weckel © INRAE