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Résumé :

Ce projet de thèse, à l’interface en statistique, biologie moléculaire et génétique, s’inscrit au sein du projet AgroDiv (projet ciblé du PEPR Agroécologie et Numérique), qui ambitionne une caractérisation fine de la variabilité génétique qui pourraient présenter un intérêt pour l’agriculture, particulièrement dans un contexte de mutation environnementale forte. Plus précisément, cette thèse vise à développer des méthodes d’analyse statistique efficaces en terme computationnel pour explorer la diversité génétique au sein d’un ensemble de sous-populations (races d’animaux de ferme, écotypes végétaux). Dans ce cadre, Jeong Hwan Ko sera en charge de la mise au point et de l’implémentation de méthodes d’intégration à grande échelle de données génétiques et omiques fonctionnelles (transcriptomiques, épigénétiques) pour explorer les associations génétiques en tenant compte du caractère multi-populations des données.

Ces méthodes seront la base pour l’identification de variants génétiques pour la régulation de l’expression, spécifiques à une sous-population donnée ou, au contraire, conservés entre plusieurs sous-populations. Les résultats permettront une meilleure caractérisation de la variabilité des phénomènes de régulation.

Contact :

Jeong Hwan Ko

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